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在分类学上,黏菌是黏菌下门(Mycetozoa)中的生物,实际上是一类变形虫。这些单细胞的生物非常“原始”,以至于微生物学家们多年来一直在争论它们究竟是动物、植物还是真菌。现代遗传学研究发现,从进化的角度来看,它们与动物和真菌的关系更近,但又介于两者之间。这表明在进化史上,黏菌是在动物、真菌和植物分道扬镳时出现的。
黏菌是单细胞的真核生物(但常常可以聚集成多细胞的结构)。